結核病16種治療藥物的快速抗藥性基因檢測

技術摘要

本設計提供基因型藥物敏感性試驗(genotypic drug susceptibility testing, gDST)檢測標的引子對組合，可預測世界衛生組織(WHO)病人治療指引中，所建議16種新舊藥物之抗藥性。本設計共分析22個與抗藥相關基因。本技術與傳統表現型藥物敏感性試驗(phenotypic drug susceptibility testing, pDST) 的黃金標準比較，本基因檢測設計的靈敏度、特異性及一致性皆高達98.8%。重要的是，可大幅縮短原須數月檢測時間的報告時效及免除新設實驗室執行DST高防護規範，極具臨床應用價值。本技術可提供開發全面性快速分子檢測試劑或搭配可攜式檢測平台開發相關檢測套組，以利實施精準醫療；可協助所須的驗證。

技術內容

結核病由結核菌群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)感染所致，抗藥性是防治上嚴峻的挑戰。有薦於pDST需於新設高防護實驗室設施內執行的規範，技術複雜且耗費人力及時間，全球陸續開發許多簡易、快速的gDST方法，依抗藥的結果供臨床病人治療及潛伏感染者預防用藥的參考。然而現有商用gDST方法有限制，價格高且僅能分析少數藥物已知的抗藥相關基因及其特定熱區(hot- spot region)，但無法分析新藥及重新被定義(repurposed)的藥物。因此，為提供全面性MTBC抗藥性檢測結果，以彌補現有pDST及gDST的缺陷。本研究開發並評估新的gDST檢測引子對組合，共22個全基因序列，以檢測16種一及二線抗結核藥物：包括rifampicin、isoniazid、ethambutol、pyrazinamide、moxifloxacin、levofloxacin、amikacin、capreomycin、kanamycin、streptomycin、rifabutin、ethionamide、clofazimine、linezolid、bedaquiline、及delamanid，已與pDST檢測結果比較：敏感性、特異性及一致性分別為97.0%、98.9%、98.3%。本技術可視檢測需求及流程設計所須藥物組合；引子對組合可搭配targeted next generation sequencing或其他分子檢測方法及平臺，提供全面且準確抗藥性預測，以強化結核病的管理及照護。

團隊簡介或技術聯絡人

周如文 博士

美國俄亥俄州州立大學

• 結核病檢測、基因體及監測整合計畫 (109-111年)
• 依世界衛生組織最新指引建立試驗方法及監測人畜抗藥性結核病 (110-111年)
• 依世界衛生組織最新結核病指引評估抗藥性試驗方法及變異監測 (109年)

吳聖韓
電話:(02)2785-0513#637
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詹岱華
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